云南地形极为复杂，大体上，西北部是高山深谷的横断山区，东部和南部是云贵高原。最高峰是西北部迪庆藏族自治州德钦县的梅里雪山，其主峰卡瓦格博峰海拔6740米。最低点是河口县的元江河谷，海拔仅有76.4米。 整个云南西北高、东南低，有84%多的面积是山地，高原、丘陵占10%，仅有不到6%是坝子、湖泊之类。个别县市的山地比重
云南地形图竟然超过了98%。
云南的地貌，以云南元江谷地和云岭山脉南段的宽谷为界，云南全省大致可以分为东西两大地形区。云南东部为滇东、滇中高原，称云南高原，属云贵高原的西部，云南平均海拔2000米左右。云南这里主要是波状起伏的低山和浑圆丘陵，发育着各种类型的岩溶地貌，云南西部为横断山脉纵谷区，高山与峡谷相间，云南地势雄奇险峻，其中以三江并流最为壮观。一般来说，云南西北部平均海拔在3000米~4000米；云南西南部平均海拔在1500米~2200米；云南靠边境地区地势逐渐和缓，平均海拔只在800米~1000米，个别地区下降至500米以下，是云南热带和亚热带地区之所在。
在云南省起伏纵横的高原山地之中，断陷盆地星罗棋布。云南这些盆地又称“坝子”，地势较为平坦，有河流通过，土壤层较厚，多为经济发达区。云南全省面积在1平方千米以上的坝子共有1445个，面积在100平方公里以上的坝子有49个，云南最大的坝子在陆良县，面积为771.99平方公里。云南名列前10位的坝子还有：昆明坝（763.6平方公里）、洱海坝（601平方公里）、昭鲁坝（524.76平方公里）、曲沾坝（435.82平方公里）、固东坝（432.79平方公里）、嵩明坝（414.6平方公里）、平远坝（406.88平方公里）、盈江坝（339.99平方公里）、蒙自坝（217平方公里）。
云南也是一个很大的地质博物馆。禄丰县的早期侏罗纪地层中曾出土大量蜥脚类恐龙化石，留存较为完整，现已在县城建成恐龙博物馆供游人参观。另外，澄江县的帽天山更是地质界中的“明星”，因为这里出土了数量多、种类丰富、留存完好的寒武纪多细胞生物的化石，有力地证明了“寒武纪生物大爆炸”的存在。昆明市东川区也是全国闻名的“泥石流博物馆”，早期这里因为大规模不科学地开采铜矿，再加上气候、地形等原因影响，形成了较大规模的泥石流频发地段，泥石流现象比较典型。