1在新结构经济学的理论建构中，林毅夫运用了四个重要的概念——要素禀赋、比较优势、市场和政府——作为支柱构建起了新结构经济学这一新的理论分析框架。坦率说，要素禀赋与比较优势，市场与政府，都是发展经济学和现代经济学理论研究中，被经常广泛讨论的概念。新结构经济学理论创新的贡献在于：一是构建了一个新的逻辑上自洽的发展经济学理论分析框架，从而在更好地总体把握前提下来研究经济发展中的经济结构变化的决定因素与驱动力量；二是更深入地研究了要素禀赋与比较优势的内在关系，及其它们影响经济结构变化及经济发展的作用机制。
毋庸讳言，《新结构经济学》的出版，仅仅是发展中国家经济学家正在努力展示自己在经济理论创新中所做出的初步成果。正如林毅夫教授所言，新结构经济学只是在为“第三波经济发展思潮开辟道路”。经济思想史表明，许多有影响的重要的经济理论创新，大都同时伴随着经济学新的重要概念的出现。无论如何，我们都有理由期待，由中国的经济学家和发展中国家的经济学家，在中国的经济发展和发展中国家的经济发展过程中所观察到和所提出的问题，会越来越多地成为全世界经济学家所关注的问题，进而成为全世界经济学家在经济学研究中理论创新的重要源泉。